学校系统查重一般是指学校内部使用的查重系统，用于检测学生论文、作业等文档的原创性和抄袭程度。通常由学校自行购买或开发，具有针对学生文档的特定功能和要求。而知网查重是指使用知网（CNKI）提供的查重服务，主要针对学术论文的查重服务。知网查重具有丰富的文献资源和专业的查重算法，能够更全面、准确地检测文献的原创性和重复率。

另外，学校系统查重一般针对学生文档的查重需求，可以根据学校的要求进行定制和调整，更符合学校内部的管理规定。而知网查重则是基于知网平台上的文献数据库，对学术论文进行查重，更注重学术领域的专业性和权威性。因此，学校系统查重和知网查重在对象范围、功能定位和适用场景等方面存在一定的差异。